يصف Cryptomator هدفه بأنه تشفير من جانب المستخدم للتخزين السحابي. يحمي المحتوى والأسماء، بينما تبقى بعض البيانات الوصفية ظاهرة، مثل أحجام الملفات وتوقيتها وعددها. يناسب ذلك إدارة الملفات في السحابة، لكنه لا يعد بإخفاء كل معلومة عن الخزنة.

يشرح دليل VeraCrypt إنشاء ملف حاوية ثم فتحه كوحدة تخزين ووضع الملفات داخله. ويمكن نقل الحاوية كملف عادي. ويحذر الدليل من أن اختيار ملف موجود ليكون هدف الحاوية الجديدة يستبدله ويفقد محتواه؛ اختر اسماً جديداً، لا اسم الملف الأصلي المراد حمايته.

للملفات التي تديرها أصلاً عبر مجلد سحابي، يتوافق سير عمل Cryptomator الموثق مباشرة مع هذا الاستخدام. ولحجم تخزين مشفر لمشروع محلي أو وسيط قابل للنقل، انظر إلى نهج VeraCrypt. يعتمد نقل الحاوية سحابياً على خدمة المزامنة؛ لم نقس استهلاك الشبكة أو تعارض الملفات أو السرعة.

يحتاج الخياران إلى نسخ احتياطية وجهاز موثوق. يحذر Cryptomator من قدرة البرمجيات الخبيثة على قراءة خزنة مفتوحة ومن النسخ المنفصلة التي قد تتركها التطبيقات. جرب ملفات غير حساسة وتحقق من إمكانية الاستعادة ثم اقفل الخزنة أو افصل الوحدة. هذه مقارنة وثائقية وليست تدقيقاً تشفيرياً.